في إطار منافسات الدور الثاني لكأس الإمبراطور 2010 تمكنت جميع أندية دوري الممتاز ما عدا فريق فيجالتا سينداي من التأهل لدور الثاني بعد تحقيقها الإنتصارات على أندية الدرجة الثالثة والهواة لتتأهل إلى الدور الثالث .
في منافسات الدور الثاني أقيمت 32 مباراة جمعت بين أندية دوري درجتي الممتاز والثانية وأندية الدرجة الثالثة والهواة التي تأهلت من الدور الأول بحيث حقق حامل اللقب فريق جامبا أوساكا إنتصاراً سهلاً على فريق جامعة أوساكا بنتيجة { 6 - 2 } ليبدأ في السير نحو هدفه المعلن وهو الفوز بكأس الإمبراطور للمرة الثالثة على التوالي .
وفي باقي مباريات الدور الثاني نجح فريق إف سي طوكيو في الإنتصار على جامعة كومازاوا بنتيجة { 2 - 0 } وفوز صعب لفريق سانفريس هيروشيما على فريق ديزولا شيماني ( دوري المناطق ) بنتيجة { 4 - 0 } وإنتصار سهل لفريق كواساكي فرونتال على فريق جامعة كانويا تايكو بنتيجة { 4 - 0 } .
وإيضاً تمكن بطل الدوري الياباني 2009 فريق كاشيما أنتلرز من تحقيق الفوز على حساب فريق آرتي تاكاساكي ( دوري الدرجة الثالثة ) بنتيجة { 6 - 0 } إلا أن اكبر النتائج في الدور الثاني كانت لمصلحة فريق ساجان توسو ( الدرجة الثانية ) والذي حقق إنتصاراً كبيراً على فريق مدرسة ثانوية كوماغاكو ( بطل دوري المدارس الثانوية ) بنتيجة { 10 - 0 }
ولكن عن أكبر المفاجأت في الدور الثاني هو سقوط أحد أندية دوري الممتاز بحيث فشل فريق فيجالتا سينداي في تجاوز جاره فريق سوني سينداي والذي يقبع بدوري الدرجة الثالثة بحيث خسر فيجالتا بهدف وحيد أتى عن طريق لاعب الوسط هيديكي كيريتا ( 30 عاماً ) والذي لا يمتلك أي عقد إحترافي بصفوف فريق سوني بسبب عدم دخول فريقه لعالم الإحتراف بعكس أندية درجتي الممتاز والثانية ليكون فريق سوني هو الوحيد من أندية الدرجة الثالثة الغير المحترفة يتأهل لدور الثالث .